MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 4703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013959	ATTA	2	8	46	53	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013959	AT	3	6	56	61	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013959	GGAA	2	8	1463	1470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013959	ACAA	2	8	1481	1488	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013959	ATT	2	6	1497	1502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013959	TTA	2	6	1527	1532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013959	A	6	6	1540	1545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013959	TAA	2	6	1546	1551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013959	TAT	2	6	1581	1586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013959	AAAG	2	8	1605	1612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013959	A	6	6	5224	5229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013959	GAA	2	6	5246	5251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013959	GAG	2	6	5253	5258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013959	GACAAT	2	12	5302	5313	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013959	AAG	2	6	5355	5360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013959	AGC	2	6	5380	5385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013959	AGAAA	2	10	5432	5441	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013959	AGC	2	6	5490	5495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013959	CGC	2	6	5617	5622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_013959	ATT	2	6	5631	5636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013959	GCCG	2	8	17142	17149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013959	TTG	2	6	17150	17155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013959	ACG	2	6	17160	17165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013959	AT	3	6	17203	17208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013959	AGG	2	6	17233	17238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013959	AAG	2	6	19270	19275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013959	TAA	2	6	19358	19363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013959	GCTG	2	8	20399	20406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013959	CAA	2	6	20433	20438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013959	A	6	6	20442	20447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013959	ATT	3	9	23116	23124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013959	GCA	2	6	24204	24209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013959	GGC	2	6	24226	24231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013959	TTTG	2	8	24245	24252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013959	GGCA	2	8	24259	24266	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013959	GATC	2	8	24294	24301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013959	ATT	2	6	24319	24324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013959	CTT	2	6	24341	24346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013959	CGTGC	2	10	24403	24412	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_013959	GAA	2	6	24418	24423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013959	AATTA	2	10	24473	24482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013959	A	6	6	24868	24873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013959	T	7	7	24890	24896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013959	TGAC	2	8	25814	25821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013959	AGA	2	6	25915	25920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013959	AT	3	6	25922	25927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013959	GAC	2	6	25929	25934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013959	TA	4	8	26880	26887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013959	TTAT	2	8	26929	26936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013959	TTCGC	2	10	26954	26963	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_013959	TCAAA	2	10	26982	26991	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013959	T	7	7	28430	28436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013959	CGAA	2	8	28475	28482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013959	GC	3	6	31572	31577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013959	GCC	2	6	35941	35946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013959	AG	3	6	35971	35976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013959	A	6	6	36854	36859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013959	CTG	2	6	36927	36932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013959	CTTT	2	8	37688	37695	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013959	AAAG	2	8	37706	37713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013959	GGC	2	6	37780	37785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013959	GAAA	2	8	37866	37873	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013959	AAG	2	6	37880	37885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013959	GC	3	6	37925	37930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013959	GGAG	2	8	37952	37959	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013959	ACA	2	6	37994	37999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013959	CA	3	6	38060	38065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013959	GCC	2	6	38109	38114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_013959	AGA	2	6	38130	38135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013959	TG	3	6	38200	38205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013959	TAAG	2	8	38214	38221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013959	CAC	2	6	38231	38236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_013959	GC	3	6	38354	38359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013959	GGAG	2	8	38381	38388	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013959	GGC	2	6	38803	38808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013959	ATT	2	6	38906	38911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013959	AC	3	6	38914	38919	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013959	TAA	2	6	38926	38931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013959	TGG	2	6	42088	42093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013959	GCG	2	6	43237	43242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013959	TCC	2	6	43261	43266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_013959	T	7	7	43332	43338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013959	CTTG	2	8	43388	43395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013959	GCG	2	6	43410	43415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013959	CGG	2	6	43416	43421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013959	GT	3	6	46012	46017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013959	AGAGGG	2	12	48871	48882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013959	GAC	2	6	48883	48888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013959	CAT	2	6	52497	52502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013959	TGC	2	6	53638	53643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013959	CGG	2	6	53670	53675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013959	TGCG	2	8	53708	53715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013959	TGC	2	6	57790	57795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013959	TCC	2	6	57801	57806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013959	CG	4	8	59757	59764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013959	GCG	2	6	60796	60801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013959	GCT	2	6	61322	61327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013959	TCAGG	2	10	67152	67161	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013959	AAT	2	6	69456	69461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013959	CAT	2	6	69465	69470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013959	CTG	2	6	69517	69522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013959	AGG	2	6	77026	77031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013959	AAG	2	6	77050	77055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013959	CAT	2	6	77062	77067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013959	GC	3	6	77114	77119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013959	CGAT	2	8	77143	77150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013959	GCCG	2	8	77180	77187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013959	TCC	2	6	77788	77793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_013959	GAT	2	6	78682	78687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013959	CAG	2	6	78701	78706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013959	ATT	2	6	78759	78764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013959	ACCA	2	8	78855	78862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013959	TGT	2	6	79153	79158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013959	T	7	7	79505	79511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013959	A	6	6	79519	79524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013959	GATCC	2	10	79591	79600	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_013959	GC	3	6	79697	79702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013959	TTG	2	6	80507	80512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013959	AGAC	2	8	80514	80521	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013959	CAT	2	6	80549	80554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013959	CGG	2	6	80555	80560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013959	GTTC	2	8	80595	80602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013959	CTTT	2	8	81561	81568	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013959	CAG	3	9	81957	81965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013959	AAG	2	6	81967	81972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013959	CACG	2	8	82034	82041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013959	CAC	2	6	82051	82056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_013959	GCAA	2	8	82073	82080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013959	CA	3	6	82094	82099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013959	TGC	2	6	82126	82131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013959	TTG	2	6	82238	82243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013959	GAA	2	6	82519	82524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013959	GA	3	6	83264	83269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013959	GAC	2	6	83965	83970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013959	GAA	2	6	83984	83989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013959	ATG	2	6	87702	87707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013959	GAGG	2	8	91330	91337	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013959	AAT	2	6	91339	91344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013959	AT	3	6	91461	91466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013959	CAT	2	6	91521	91526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013959	AT	3	6	91541	91546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013959	ATT	2	6	91563	91568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013959	GA	3	6	91701	91706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013959	AAC	2	6	91745	91750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013959	CCG	2	6	91751	91756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_013959	GTC	2	6	91784	91789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013959	GAC	2	6	91800	91805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_013959	CGG	2	6	91847	91852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_013959	TAG	2	6	91857	91862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_013959	AAT	2	6	181755	181760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_013959	TTGC	2	8	181784	181791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
290	NC_013959	GAA	2	6	181801	181806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_013959	TTG	2	6	182293	182298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_013959	ACT	2	6	182307	182312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_013959	GAG	2	6	182466	182471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
295	NC_013959	GGC	2	6	182716	182721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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310	NC_013959	TGC	2	6	197321	197326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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362	NC_013959	GA	3	6	244337	244342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_013959	GTT	2	6	285756	285761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_013959	TCT	2	6	285891	285896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_013959	CAGGG	2	10	297136	297145	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
446	NC_013959	AAC	2	6	297146	297151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_013959	CAT	2	6	297483	297488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_013959	TAA	2	6	311287	311292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_013959	ACA	2	6	345249	345254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_013959	TGC	2	6	345269	345274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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